«نیلو و فلندی» بر اساس یک رُمان انگلیسی از ماریا لوئیز رمه که در ۱۸۷۲ نوشته شده بود، ساخته شده. این داستانِ بسیار غم‌انگیزکه در کشور بلژیک اتفاق می‌افتد، در نسخۀ فارسی آن تعدیل شده و از غمگینی آن کمی کاسته شده است. نیلو پسر مهربانی است که هر روز همراه با سگ وفادارش فلندی در کار شیرفروشی به پدربزرگ کمک می‌کند. نیلو که همراه پدربزرگ فقیرش زندگی می‌کند در ۲ سالگی مادرش را از دست داده است. نیلو در کار شیرفروشی به پدربزرگ کمک می‌کند. در این میان سگی را پیدا کرده که مورد ضرب و شتم بسیار قرار گرفته بود. نیلو سگ را از خطر مرگ نجات می‌دهد و او را نزد خود نگه می‌دارد. فروشندۀ دوره‌گردی که ظاهراً صاحب اصلی سگ بوده و او را رها کرده بود، آنها را تعقیب می‌کند. او تصمیم دارد دوباره فلندی (با نام اصلی پاتراش) را بدست آورد و از او کار بکشد. اما نیلو هرطور هست فلندی را از دست دوره‌گرد می‌رهاند. فلندی در کنار نیلو معنی آزادی را درک می‌کند و شاد و خوشحال در کارها به او و پدربزرگش کمک می‌کند.